為什么要進(jìn)行細(xì)胞系鑒定？
據(jù)統(tǒng)計，目前有超過30%的細(xì)胞系被錯誤辨識或受到交叉污染。2010年《國際癌癥雜志》(IJC)統(tǒng)計出一列表，在346篇文章中，有103篇存在細(xì)胞被Hela細(xì)胞污染的情況。最可怕的錯用是在瑞典某大學(xué)的一個研究組里，該研究組從1988年起就錯誤的使用了Hela，以為是lnt-407細(xì)胞系，并因此在從1988到2011年里發(fā)表了41篇論文，全部是錯的。這些文章發(fā)在Oncogen, JBC, Carcinogenesis, PLoS One, J Cell Physiol, Cancer Res, Br J Cancer, Biochem J, Exp Cell Res等眾多高質(zhì)量的雜志上。
近年來，大量研究表明 STR 基因分型方法是進(jìn)行細(xì)胞交叉污染和性質(zhì)鑒定的最有效和準(zhǔn)確的方法之一，STR基因分型應(yīng)用于細(xì)胞鑒定已被ATCC等機(jī)構(gòu)強烈推薦。美國的ATCC 細(xì)胞庫、德國的DSMZ細(xì)胞庫以及日本的JCRB細(xì)胞庫等為STR 分型提供了各細(xì)胞株的數(shù)據(jù)供比對。越來越多的雜志在投稿時要求撰稿人提供細(xì)胞STR分析數(shù)據(jù)，STR已被ATCC等機(jī)構(gòu)作為細(xì)胞鑒定的金標(biāo)準(zhǔn)。
什么是細(xì)胞系STR鑒定？
● STR（Short tandem repeats，短串聯(lián)重復(fù)序列）基因位點由長度為3~7個堿基對的短串聯(lián)重復(fù)序列組成，這些重復(fù)序列廣泛存在于基因組中，可作為高度多態(tài)性標(biāo)記，被稱為細(xì)胞的DNA指紋，其可通過PCR（聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)）來檢測。
● STR基因座位上的等位基因可通過擴(kuò)增區(qū)域內(nèi)重復(fù)序列的拷貝數(shù)的不同來區(qū)分，在毛細(xì)管電泳分離之后可通過熒光檢測來識別。隨后通過一定的計算方法，所得的STR分型結(jié)果與權(quán)威的細(xì)胞STR數(shù)據(jù)庫比對，從而推算出樣品所屬的細(xì)胞系。
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鑒定流程
什么時候需要細(xì)胞系STR鑒定？
發(fā)表文章或申請課題經(jīng)費前；
使用細(xì)胞進(jìn)行臨床治療（試驗）前；
準(zhǔn)備凍存保種或已凍存多年的細(xì)胞；
一個涉及到細(xì)胞試驗項目開始/結(jié)束時；
新得到的細(xì)胞或?qū)嶒炇遗囵B(yǎng)5代以上的細(xì)胞；
細(xì)胞系表現(xiàn)不穩(wěn)定或結(jié)果與預(yù)期差別較大；
異體細(xì)胞移植后嵌合情況檢查。
這樣將避免由于細(xì)胞系交叉污染或身份誤認(rèn)，導(dǎo)致的金錢、時間的浪費和無效實驗數(shù)據(jù)的產(chǎn)生。
人源細(xì)胞的鑒定-STR鑒定
STR基因分型已被ICLAC、ATCC等權(quán)威機(jī)構(gòu)作為金標(biāo)準(zhǔn)應(yīng)用于細(xì)胞鑒定，目前主要基于國際身份認(rèn)證委員會的標(biāo)準(zhǔn)。依據(jù)該標(biāo)準(zhǔn)，可以通過多重?zé)晒釶CR技術(shù)，對人源常見的20個STR位點以及1個性別決定位點進(jìn)行檢測。
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小鼠細(xì)胞的鑒定-STR鑒定
國內(nèi)STR基因分型常見人類STR，當(dāng)科研用到小鼠源細(xì)胞，該怎么提供STR鑒定結(jié)果呢？
賽庫是國內(nèi)首家推出小鼠源細(xì)胞STR鑒定的生物公司，參考ATCC細(xì)胞鑒定金標(biāo)準(zhǔn)ANSI/ATCC ASN-0002-2011——STR基因分型技術(shù)，創(chuàng)建小鼠源細(xì)胞DNA指紋檢測系統(tǒng)，聯(lián)用18個位點（人源細(xì)胞系鑒定我們采用21位點），多種熒光探針標(biāo)記，精準(zhǔn)鑒別小鼠源細(xì)胞。賽庫生物擁有5年以上細(xì)胞鑒定經(jīng)驗，為您提供專業(yè)的細(xì)胞鑒定服務(wù)。
樣品要求
樣品要求
活細(xì)胞：T25培養(yǎng)瓶，60%-70%密度，細(xì)胞數(shù)>106個，寄出前灌滿培養(yǎng)基封口膜密封蓋子，常溫運輸。
細(xì)胞沉淀/凍存細(xì)胞：細(xì)胞數(shù)量需≥106，干冰運輸。
DNA樣本：OD260/OD280=1.8~2.0，DNA濃度≥50ng/uL，DNA體積≥20uL。
賽庫生物--小鼠短串聯(lián)重復(fù)序列的多重擴(kuò)增體系及檢測試劑盒發(fā)明專利
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